利用CIRBP作為胰腺癌診斷及治療分子標記物(細胞增殖生長曲線檢測步驟)
RIP技術(RNABindingProteinImmunoprecipitation,RNA結合蛋白免疫沉淀),是研究細胞內RNA與蛋白結合情況的技術。運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來,然后經過分離純化就可以對結合在復合物上的RNA進行分析;即用抗體或表位標記物捕獲細胞核內或細胞質中內源性的RNA結合蛋白,防止非特異性的RNA的結合,免疫沉淀把RNA結合蛋白及其結合的RNA一起分離出來,結合的RNA序列通過microarray(RIP-Chip),定量RT-PCR或高通量測序(RIP-Seq)方法來鑒定;目標蛋白是一種應激反應蛋白,在應激反應過程中,可以從細胞核遷移到細胞質,此外,目標蛋白還可以從細胞中分泌出來,在細胞外作為損傷相關分子模式發揮功能,促進炎癥反應,并在急性和慢性炎癥中發揮重要作用。
一種利用CIRBP作為胰腺癌診斷及治療分子標記物的方法,所述方法步驟包括如下:
步驟1:材料準備,準備試劑細胞培養試劑:胎牛血清,DMEM-高糖培養基,RPMI-1640培養基,青鏈霉素,PBS磷酸鉀緩沖液,Trypsin-EDTA(0.25%)phenol red以及實驗耗材6孔板細胞培養板,12孔板細胞培養板,24孔板細胞培養板,48孔板細胞培養板,96孔板細胞培養板,巴氏吸管;
步驟2:細胞復蘇,將水浴鍋預熱至37℃,用75%酒精擦拭紫外線照射30min的超凈工作臺臺面,在超凈工作臺中按次序擺放好消過毒的離心管、吸管、培養瓶等等,取出凍存管,迅速解凍,迅速將凍存管投入到已經預熱的水浴鍋中迅速解凍,并要不斷的搖動,使管中的液體迅速融化,在凍存管內還存在一點點沒融化的時候,取出,用酒精棉球擦拭凍存管的外壁,再拿入超凈臺內,制備細胞懸液,將細胞轉移至一個15ml離心管內,一滴一滴地加入預熱好的培養基,同時一邊晃動離心管;加入培養基的量要達到10ml以上,離心,在低速離心機上,以800rpm離心5分鐘;吸去上清,然后用1ml培養基重懸細胞,將細胞懸液分裝入培養皿內,將培養皿放入37℃含CO2的培養箱內培養,換液的時間由細胞沉降速度情況而定;
步驟3:細胞培養,將水浴鍋預熱至37℃,用75%酒精擦拭紫外線照射30min的超凈工作臺臺面,在超凈工作臺中按次序擺放好消過毒的離心管、吸管、培養瓶等等,取出細胞培養瓶,無菌操作,打開瓶蓋,吸掉舊培養液,用PBS洗滌細胞一至二次,加入trypsin-EDTA溶液(1ml/25cm2,2ml/75cm2),輕洗細胞皿底部,吸掉trypsin-EDTA溶液,放入37℃培養箱2-3分鐘,輕拍培養瓶壁使大部分細胞脫落,于倒立顯微鏡下觀察,當細胞將要分離而呈現圓粒狀時,加入適量含血清之新鮮培養基終止trypsin作用;
步驟4:實驗分組,檢測項目為RIP檢測CIRBP調控TP53、、PCR檢測CIRBP、TP53、wb、CIRBP、ACSL4、PTGS2、NOX1、GPX4、FTH1、普魯士藍染色、激光共聚焦檢測線粒體活性氧ROS、谷胱甘肽GSH檢測、流式凋亡檢測、細胞增殖生長曲線檢測;
步驟4中細胞增殖生長曲線檢測步驟為a:取各處理組細胞進行下面實驗;b:消化細胞后吹打散細胞,計數,調整細胞濃度為1×105個/ml,分到96孔板,每孔100ul,即每孔細胞為1×104個;c:貼壁細胞需待細胞貼壁后,再收集各時間點細胞進行檢測;d:收集各個時間點的細胞(0h,24h,48h,72h)加入CCK-8溶液(碧云天,Cat.No.C0037),比例為1/10。即100ul培養液加入10ul檢測液;e:在孵育4小時后,酶標儀讀板,CCK-8檢測讀取OD450數據。
步驟5:RIP檢測P CIRBP調控TP53。
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