鵪鶉肺炎克雷伯菌血清型鑒定、耐藥性檢測(cè)及致病潛力（二）
1.516SrDNA鑒定和遺傳進(jìn)化分析
使用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒提取純培養(yǎng)菌株的全基因組，參考Colodner等方法使用16SrDNA通用引物27F（5‘-AGAGTTTGATC-MTGGCTCAG-3’）和1492R（5‘-GGTTACCTTG-TTACGACTT-3’）進(jìn)行PCR擴(kuò)增，PCR反應(yīng)體系25μL:2×EasyTaqPCRSuperMix（+Dye）12.5μL,上、下游引物各0.6μL,DNA模板1.0μL,ddH2O10.3μL.PCR擴(kuò)增程序：94℃預(yù)變性5min;94℃變性30s,54℃退火30s,72℃延伸30s,共35個(gè)循環(huán)；72℃延伸10min;4℃保存。PCR產(chǎn)物用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)，并送至生工生物工程（上海）股份有限公司進(jìn)行測(cè)序拼接，測(cè)序結(jié)果在NCBI中BLAST進(jìn)行序列比對(duì)，使用Mega11.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。
1.6肺炎克雷伯菌特異性
基因檢測(cè)以提取的細(xì)菌DNA為模板，參考吳自豪等研究報(bào)道的引物（F1:5‘-CGATTCTGGAAATGG-CAAAAG-3’；R1:5‘-CGTGATCAGCGGTGACT-ATGAC-3’），對(duì)腸桿菌科特異性基因phoA進(jìn)行PCR擴(kuò)增，預(yù)期擴(kuò)增產(chǎn)物大小為720bp.PCR反應(yīng)體系及程序同1.5,其中退火溫度為58℃。參考王樂等方法，使用特異性引物（F2:5‘-TGA-TTGCATTCGCCACTGG-3’；R2:5‘-GGTCAACC-CAACGATCCTG-3’）對(duì)肺炎克雷伯菌溶血菌素基因khe進(jìn)行PCR擴(kuò)增，預(yù)期擴(kuò)增產(chǎn)物大小為498bp.PCR反應(yīng)體系及程序同1.5,其中退火溫度為56℃。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。
1.7肺炎克雷伯菌莢膜血清型檢測(cè)
參考解秀梅等研究合成肺炎克雷伯菌7種常見莢膜血清型引物，PCR反應(yīng)體系及程序同1.5,退火溫度見表1.PCR擴(kuò)增產(chǎn)物通過1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。
表1肺炎克雷伯菌莢膜血清型引物序列
1.8藥物敏感性檢測(cè)
使用K-B法檢測(cè)分離菌株對(duì)β-內(nèi)酰胺類、四環(huán)素類、氯霉素類、多肽類、氨基糖苷類、磺胺類、喹諾酮類以及大環(huán)內(nèi)酯類等9大類24種常見抗菌藥物的敏感性。用無菌涂布器將純培養(yǎng)菌液均勻涂布于LB瓊脂培養(yǎng)基，并在 oCelloScope 中于 37°C 下培養(yǎng)（無需搖動(dòng)）。每 30分鐘至 10 小時(shí)采集一次圖像。每個(gè)樣品一式三份進(jìn)行分析，并計(jì)算平均值和標(biāo)準(zhǔn)差。
1.9耐藥基因檢測(cè)
參考文獻(xiàn)合成肺炎克雷伯菌5大類11種耐藥基因引物，PCR反應(yīng)體系及程序同1.5,退火溫度見表2.PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。
表2耐藥基因引物序列
1.10毒力基因檢測(cè)參考文獻(xiàn)合成肺炎克雷伯菌18種毒力基因特異性引物，利用PCR擴(kuò)增檢測(cè)分離株攜帶毒力基因情況。PCR反應(yīng)體系及程序同1.5,退火溫度見表3,PCR產(chǎn)物進(jìn)行1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。
表3毒力基因引物序列
1.11生物學(xué)特性分析
1.11.1生長(zhǎng)曲線測(cè)定
實(shí)驗(yàn)中，將過夜培養(yǎng)的細(xì)菌稀釋至初始細(xì)胞密度為104CFU/mL,然后將不同濃度的XO和LPO添加到96孔板中，每種條件設(shè)置三份重復(fù)。oCelloScope被放置在37°C、5%CO?的培養(yǎng)箱中，每隔15分鐘對(duì)每個(gè)孔進(jìn)行兩次掃描，持續(xù)監(jiān)測(cè)24小時(shí)。通過背景校正的吸收算法，生成細(xì)菌生長(zhǎng)曲線，并計(jì)算每個(gè)時(shí)間點(diǎn)的平均增長(zhǎng)量。以接種時(shí)間為橫軸、D600nm值為縱軸繪制細(xì)菌生長(zhǎng)曲線。
1.11.2酸堿耐受性測(cè)定
取150μL純培養(yǎng)菌液分別接種于5mLpH為2.0、3.0、4.0、5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0、11.0、12.0的LB肉湯培養(yǎng)基，于37℃、180r/min搖床孵育24h,使用丹麥Biosense微生物動(dòng)態(tài)曲線監(jiān)測(cè)系統(tǒng)測(cè)定菌液D600nm值，試驗(yàn)設(shè)置3個(gè)重復(fù)，取平均值，利用Origin2024軟件作圖，以pH為橫軸、D600nm值為縱軸繪制pH穩(wěn)定曲線。
1.11.3接種量測(cè)定
分別向5mLLB肉湯培養(yǎng)基中加入50、100、150、200、250μL純培養(yǎng)菌液，使接種量依次達(dá)到培養(yǎng)基體積的1%、2%、3%、4%、5%,于37℃、180r/min搖床孵育12h,使用丹麥Biosense微生物動(dòng)態(tài)曲線監(jiān)測(cè)系統(tǒng)測(cè)定菌液D600nm值，試驗(yàn)設(shè)置3個(gè)重復(fù)，取平均值，利用Origin2024軟件作圖，以接種量為橫軸、D600nm值為縱軸繪制接種曲線。
1.12致病性試驗(yàn)
將分離菌接種于LB液體培養(yǎng)基中，并于最適條件下培養(yǎng)，隨后進(jìn)行平板計(jì)數(shù)，并計(jì)算其菌液濃度，按照測(cè)定結(jié)果，將菌液稀釋成不同濃度（1×105、1×106、1×107、1×108、1×109CFU/mL）。將120只小鼠分為12組，其中2組為對(duì)照組，其余10組為不同濃度菌株處理組（每株菌5個(gè)濃度組），每組10只小鼠。對(duì)照組小鼠注射0.5mL生理鹽水，其他各組小鼠分別注射不同濃度菌液（0.5mL/只）。攻毒12h后開始觀察，記錄1周內(nèi)小鼠發(fā)病和死亡情況，用寇氏改良法計(jì)算分離菌株對(duì)小鼠的半數(shù)致死量（LD50）。
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