膿腫分枝桿菌胞內菌落計數、對RAW264.7細胞血紅素氧化酶1調控自噬影響（二）
1.1.2主要試劑和儀器
高糖DMEM培養基購于普賽諾公司；Cobaltic ProtoporphyrinⅨChloride（CoPP）（Cat#sc-294098）、Tin ProtoporphyrinⅨdichloride（SnPP）（Cat#sc-203452）購于美國Santa cruz公司；抗LC3Ⅰ/Ⅱ抗體（Cat#12741S）、抗ATG5抗體（Cat#12994）、抗GADPH抗體（Cat#5174）、第二抗體抗兔IgG抗體（Cat#7074S）購于美國CST公司；HO-1（Cat#10701-1-AP）購于Proteintech公司；SQSTM1/p62（Cat#AG4400）、特級胎牛血清（Cat#13011-8611）購于碧云天生物技術公司；CCK8（Cat#K1018）、3-MA（Cat#A8353）購于APEXBIO公司；LysoTracker Red DND-99（Cat#MX4317-50UL）購于懋康生物技術有限公司；DAPI購于Bioss公司；TNF-α（Cat#87E2072700）為云克隆產品；6孔板購于NEST公司；阿米卡星注射液購于宜昌人福藥業有限公司。顯影膠片（Cat#YA0360）為柯達公司產品；蛋白電泳槽為Bio-Rad公司產品；轉膜儀為北京六一生物科技有限公司產品；免疫熒光顯微鏡為Nikon DS-Qi2型號。
1.2方法
1.2.1 M.abs培養及準備
將M.abs標準株ATCC19977接種于7H9液體培養基，培養3~5 d，取對數生長期細菌，調整細菌濃度1.5×108 CFU/ml，用于后續實驗。
1.2.2 RAW264.7細胞培養及M.abs刺激
RAW264.7細胞培養于含10%FBS的高糖DMEM培養基。當細胞濃度達到80%貼壁時，無菌PBS清洗3次，含0.2%EDTA胰酶消化2 min，調整細胞密度為2.5×105個/ml，取2 ml鋪于6孔板，待細胞完全貼壁后，加入30μmol/L CoPP或30μmol/L SnPP預處理12 h，在RAW264.7巨噬細胞培養基內分別以感染復數（MOI）（M.abs∶RAW264.7）為5∶1、10∶1和15∶1比例加入M.abs刺激2 h（活菌濃度分別為：2.5×106 CFU/ml、5×106 CFU/ml、7.5×106 CFU/ml），無菌PBS漂洗3次，加入含34μg/ml阿米卡星完全培養基作用2 h去除胞外菌，無菌PBS漂洗3次，繼續培養至指定時間，收集不同時間點細胞蛋白保存于-20℃待測（蛋白提取見1.2.4）。
1.2.3 CCK-8檢測細胞活性
CCK-8檢測參照試劑說明書進行，簡要操作如下：調整RAW264.7細胞密度2.5×105個/ml，吸取100μl鋪于96孔板，待細胞完全貼壁后，加入終濃度為30μmol/L CoPP和30μmol/L SnPP處理48 h或直接加入M.abs共孵育48 h，處理完畢后，分別加入CCK-8檢測溶液10μl，繼續培養4 h，檢測A450。細胞活力（%）=（實驗組吸光度-空白組吸光度）/（對照組吸光度-空白組吸光度）×100%。所有實驗濃度均設3個復孔，重復3次，取平均值計算。
1.2.4 Western blot
細胞按照實驗設計方案處理結束后，每孔加入含蛋白酶和磷酸酶抑制劑coctail的RIPA緩沖液200μl，收集細胞并置冰上裂解30 min，將蛋白裂解液于4℃、12 000 r/min離心15 min，收集上清用BCA蛋白測定試劑盒檢測待檢樣本濃度，置于-20℃冰箱保存。取20μg蛋白與5×蛋白上樣緩沖液混合，置于100℃金屬浴5 min，取等量制備好的蛋白樣品進行SDS-PAGE電泳，電泳完畢后，將蛋白通過轉膜儀轉移到0.45μm PVDF膜上，PBST稍微漂洗后用5%脫脂牛奶封閉1 h，孵育一抗4℃過夜（抗HO-1抗體、抗ATG5抗體、抗LC3Ⅰ/Ⅱ抗體、抗p62抗體和抗GAPDH抗體），PBST漂洗3次，每次5 min。孵育相應的二抗，室溫放置1 h，再次用PBST漂洗3次，每次5 min。ECL顯影液進行顯影。采用Image J軟件進行灰度分析。
1.2.5 LysoTracker Red染色
調整細胞濃度2.5×105個/ml，并取1 ml接種到含細胞爬片的12孔板中，待細胞完全貼壁后，按照實驗設計CoPP和SnPP預處理細胞12 h，加入M.abs（MOI=5）共孵育2 h，無菌PBS洗3次，重新加入含LysoTracker Red（200 nmol/L）完全培養基繼續培養1 h，無菌PBS洗3次后，加入DAPI染液進行細胞核染色10 min，免疫熒光顯微鏡進行細胞觀察并拍照保存，采用Image J軟件對各組進行量化分析。